维护国家安全
- 防止有害生物入侵
- 限制某些动植物及其制品的进出口，是为了防止外来有害生物传入，一些外来的昆虫、病菌可能会对本国的农业、林业等生态系统造成严重破坏，像美国白蛾，一旦传入，会大量啃食多种树木叶片,严重影响森林资源和生态环境。
- 对进口农产品进行严格检验检疫，防止携带未被发现的病虫害进入国内，保护国内农作物的产量和质量安全,确保国家粮食安全和农业可持续发展。
- 防范武器弹药等危险物品流入
限制武器弹药、爆炸物等危险物品的进出口，这是直接关系到国家安全的关键举措，非法流入的武器弹药可能会被用于恐怖活动、犯罪行为或威胁国家主权和社会稳定，海关通过严格检查和管控，阻止此类物品进入国内,保障人民生命财产安全和国家的和平稳定环境。
保护本国产业
- 保护国内制造业
对一些特定商品设置进口限制，如对某些电子产品、机械设备等设置关税壁垒或配额限制等，这有助于保护本国同类产业的发展，避免因大量低价进口商品冲击，导致国内相关企业市场份额下降、生产萎缩、失业增加等问题，对国内尚处于发展阶段的汽车制造业，适当限制汽车进口数量，能为国内汽车企业提供一定的市场空间,促进其技术研发和产业升级。
- 扶持农业等基础产业
通过关税调节、进口配额等手段限制农产品进口，比如提高进口农产品关税，使进口农产品价格上升，相对提高国内农产品竞争力，保护国内农民利益，保障国内农业生产稳定，维持农业在国民经济中的基础地位，对于国内一些特色农业产业，如特定品种的水果、茶叶等，限制相关相似国外品种的无序进入,保护国内特色农业产业的独特优势和可持续发展。
保障公共健康和安全
- 食品和药品安全
海关对进口食品进行严格检验检疫，检查食品是否符合国内的食品安全标准，包括是否含有有害物质、是否过期变质等，对于药品进口，同样严格审查其质量、疗效、安全性等，防止未经批准或存在质量问题的药品流入国内，保障民众用药安全，曾经有过因进口食品中含有超标添加剂或微生物污染等问题被海关拦截的案例,避免了这些不合格食品进入市场危害消费者健康。
- 商品质量与安全标准
对各类进口商品的质量和安全标准进行把关，确保其符合国内相关法规和标准要求，比如对进口电器产品，检查其电气安全性能、电磁兼容性等指标，防止存在安全隐患的产品流入国内市场，保障消费者使用安全，对于儿童玩具等商品，严格检查其材质安全性、机械安全性等,避免儿童因使用不安全玩具而受到伤害。
规范贸易秩序
- 防止走私和偷逃税
海关限制的一个重要目的是打击走私行为，走私活动通过逃避海关监管偷逃税款、非法运输违禁品等，严重破坏正常的贸易秩序，损害国家利益，海关加强监管，严厉打击走私，维护公平有序的贸易环境,保证合法进出口企业能够在正常的市场规则下开展经营活动。
- 执行贸易政策和国际协定
海关依据国家的贸易政策和所签订的国际协定来实施限制措施，根据国际贸易协定中的关税减让承诺和贸易规则，对不同国家的商品进行分类管理和关税征收；执行进出口许可证制度等，确保贸易活动按照规定的渠道和条件进行，促进国际贸易的规范化和有序发展，同时维护国家在国际贸易中的权益。
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